深度解读
一、国家政策不同
1、为了扶持和鼓励高新技术企业的发展，国家政府对高新技术企业制定了具体的管理办法和认定指引，办法和指引主要是规定了高新技术企业的指标和认定要求，两者都对高新企业做出了明确的规划，并保证了高新技术企业日常行为的规范化和相关的战略思路；
2、软件产业是知识经济时代的主导产业，只是相比于高新企业认证，软件企业认定管理办法比较局限，主要的目的是贯彻国务院鼓励软件产业和集成电路产业发展的若干政策实施意见，是为了进一步推动本市软件产业和集成电路产业的发展而制定的相关政策。
二、政府审批部门不同
1、高新企业认证由各省、自治区或者直辖市的科技管理部门，财政部门以及税收部门组成的认定机构进行评审和考察；
2、软件企业的认证是由软件协会负责的。
三、有效期限和年审规定不同
1、高新技术企业有限期为三年，三年到期再重新复审，高新企业认证通过后的企业需按照相关规定申报统计和科创委系统。
2、软件企业每年都要年检，需要根据指标在每年的六月份之前提供相应的资料并办理软件企业年检，如果通过了可以享受上一年度的企业所得税减免，如果没有通过就不能享受企业所得税减免。
四、所享受的企业所得税优惠不同
1、高新企业认证后，企业的所得税税率会由原先的25%减少为15%；
2、软件企业认定成果后，按相关规定从获利年度起的第一年和第二年免征企业所得税，第三年到第五年就开始减半征收企业的所得税，享受完五年的所得税优惠后，企业就不再享受任何企业所得税优惠政策(包括高新企业优惠政策)，所得税会按25%征收。
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