一、注意知识产权与其他指标的联系
在整理知识产权相关材料时，要保证产权能体现“研发项目-科技成果-高新产品-知识产权-技术领域”之间的相关性的，也就是说不管是企业的研发活动、高新技术产品、核心知识产权都一定要同属一个高新技术领域，并且都符合国家高新技术企业认定标准。
哪怕企业处于转型期，也要保证前期的研发和知识产权所属领域不会受到影响，除非转型后的企业收入超过了原有的产品收入达到60%以上。
在知识产权管理方面，最好是进行自主研发，因为受让转让等形式获得的产权得分较低。另外就是要保证产权权属人均为申报企业，产权还在有效期限内，可以提供缴费明细账单。
二、注意科研成果技术性证明材料
最新修订国家高新技术企业认定标准中，科技成果转化的分数依然是30分，但是门槛提高了，即要达到A档的要求不仅要提交5项以上的科技成果还要上交技术描述性证明材料。
对公司来说，首先要准确把握政策中对科技成果的要求，精准理清楚成果转化之间的逻辑关系，在梳理材料的过程中，从已有的技术还有成果为出发点，以成果或者技术带来的效应为落脚点，找到中间的对应关系，提取出有价值的技术说明，并一一找到对应的证明性资料。
其次，要整理和归集好各项符合高新技术企业申报认定的证明材料，证明的资料越有说服力，通过的可能性就更高。
三、注意专项审计报告合理性
1、研发费用专审报告：
（1）研发费用的结构符合高新规定且合理，不同的研发活动结构明细不同。
（2）研发费用辅助账符合高新要求，在年审报告、汇算清缴报告中要进行披露，所披露的数据前后不能出现矛盾。
2、高新收入专审报告：
（1）高新产品的名称、合同发票要符合高新申报规定。
（2）高新产品的支撑技术领域要在高新领域范围内。
（3）高新产品的证明资料，除了提供合同发票外，还可提交第三方认定、检测报告等。
四、注意各类报表的数据资料
1、财务报表中最核心的内容为资产负债表、利润表以及现金流量表三表，需要特别注意的是，年度纳税申报表”和财务报表中的“利润表”和“资产负债表”的“营业收入”等指标要一致，不一致的要在高新技术企业申报认定材料中附上理由。
2、企业要确保年审报告中数据的一致性，包括每份审计报的上年度年末数据与今年度年初数据的对应；且年审报告、研发专审报告及所得税纳税申报表三表呈现的研发费数据要保持一致。
公司申请高新技术企业，需要公司的研发、财务以及人力资源等部门的配合。 因此企业需要先设定一套完整且合理的申报方案，组建专门的团队负责高新资质的相关工作，也可咨询高新代办公司。
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