在实际操作中，很多企业被高新认定和加计扣除的研发费用归集口径混淆，高新认定的研发费用不是都能享受加计扣除的！高新技术企业申报的研发费用范围一般大于研发费加计扣除的范围。
比如说折旧费，一般建筑物的折旧费是不能加计扣除的，但高新可以；而对于经营租赁费，加计扣除里只允许用于研发的仪器、设备租赁等费用，厂房是不可以的，但高新就可以。同时高新研发费用里还包括了装备调试费，田间实施费以及通讯费这些费用，但加计扣除里是不包括的；委托研发的费用高新认定可以委托境内外一起研发，但加计扣除只能是委托境内机构或个人进行研发。
另外高新规定其他相关费用的比例不得超过研发总费用的20%，而加计扣除里规定的比例是不得超过10%。
最后对研发人员的定义，高新认定研发费用只要是企业科技人员都可归集，加计扣除必须是直接从事研发活动的人员。对于对科技人员，高新要求累计人员的实际工作时间要满足183天以上，而加计扣除里则没有这个要求。
只要弄清楚研发费用的归集关系，企业是可以顺利享受到研发费用加计扣除优惠的，但如果未能享受到研发资助的话，可能出现了以下这几种情况：
1、企业没有及时填报科技统计报表。高新技术企业申报有规定，企业认定高新成功后需要做好明年的填报工作，才可享受明年的研究开发资助；
2、数据填报差错问题。企业按时填报了报表，但是连续两年在科创委的数据与报国家统计报表数据误差超出正常范围的企业，相关部门也是不会安排给企业研发费用加计扣除优惠的！
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