申请高新技术企业，研发项目至关重要，基本上所有的材料都是围绕着研发项目展开的，如研发费用专审报告、科技成果转化相关资料以及知识产权归集等，而研发项目的确定是遵循一定原则的。
一、研发项目“三确定”原则
1、确定研发费用
在开展研发项目前，企业需要先依据高新企业的标准确定具体要投入的研发费用比例：
近一年内销售所得收入在5000万以下的，投入的占比要高于5%；在5000万-20000万之间的要高于4%；在20000万以上的比例要高于3%。
2、确定研发项目数量
确定最终的研发费用后，企业要确定研发项目数量，需保证每年至少有5个以上的成果转化，若一个项目可以产生几个成果的可以依据情况调整数量。
3、确定研发项目课题
确定每年需要研发的项目后，再依据高新技术企业认定办法的要求，确定出以下具体的研发内容：
（1）根据企业本年度、下年度的主营产品性质以及高新产品，确定研发方向。
（2）根据主营产品，和高新产品有关的研发方向罗列出相关的项目，确定哪些项目可以产生专利，为日后归集知识产权和高新技术产品（PS）做好准备。
（3）根据本年度、历年的主营产品和高新产品，及预计产生专利的项目，筛选研发项目进行立项工作。
二、研发活动“五区分”原则
开展研发活动时，企业需要依据高新企业的标准区分好以下五大要素，为日后进行研发费用归集做好充足准备，节约日后整理的时间：
1、区分研发以及非研发的设备折旧
用于研发设备的折旧一般要计入到研发支出这一栏中，非研发设备的折旧一般计入制造费用或期间费用中。
2、区分研员以及非研发人员的工资
工资单和研发规划名单应与研发人员名单保持一致，确保社保结算单中能一一找到所有研发人员的缴费记录。
如果有混合的工资应采取合理的办法在研发人员和非研发人员之间分摊。
3、区分研发和非研发材料
在分配研发材料时，最好分别制作出研发和非研发部门的领料单，并做好详细的记录。
4、区分研发和非研发在动力方面的费用
建议在动力管道通往研发场所的合适部位加装水表、电表等计量装置，月末时统计出计量装置将研发以及非研发的动力耗用量。
5、区分其他研发费用
高新技术企业认定办法要求的其他费用包括以下几类：
(1)研发设备运行维护、调整、检验、维修等费用
(2)新药研制在临床方面的试验费
(3)用于鉴定研发成果的费用
(4)与研发有关的图书资料费、资料翻译费、成果论证、评审和验收费用等相关费用。
申请高新技术企业需要全面梳理过去三年的研究开发活动，包括新产品的研究开发、工艺流程的更新换代等，并整理出与研发项目有关的所有材料，资料越充分，分数就越高，通过率就越有把握！
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